سخنگوی مقاومت اسلامی نُجَباء ترور دانشمند برجسته ایرانی را تسلیت گفت و آن را اقدامی بزدلانه خواند.  

معاون دبیرکل حزب الله لبنان شهادت دانشمند هسته‌ای ایران را بخشی از جنگ علیه آزادگان منطقه توصیف کرد و گفت: ایران به این جنایت پاسخ می‌دهد و البته که ما از این ترورها نمی‌ترسیم.  

ترور شهید محسن فخری‌زاده رییس سازمان پژوهش و نوآوری توسط تروریست های کوردل در صدر اخبار رسانه های روسیه قرار گرفت.  

دونالد ترامپ رییس جمهوری آمریکا در واکنش به ترور شهید محسن فخری زاده رییس سازمان پژوهش و نوآوری وزارت دفاع ایران، توئیت یک خبرنگار صهیونیستی در این مورد را بازنشر کرد.  

فرمانده سپاه پاسداران انقلاب اسلامی گفت: طراحان، عاملان و حامیان ترور شهید فخری‌زاده بدانند اینگونه جنایات در عزم و اراده ایرانیان خللی ایجاد نخواهد کرد و انتقام و مجازات سخت آنان در دستور کار قرار گرفته است.  

  جنبش جهاد اسلامی فلسطین ترور شهید محسن فخری زاده را محکوم و تاکید کرد که نبرد محور مقاومت به رهبری ایران با دشمن صهیونیستی - آمریکایی ادامه خواهد داشت.  

جنبش انصارالله یمن با محکوم کردن ترور محسن فخری زاده دانشمند هسته ای و شهید صنعت دفاعی کشورمان،  شهادت وی را تسلیت گفت.  

معاون اول رییس جمهوری در پیامی با تسلیت شهادت رییس سازمان پژوهش و نوآوری وزارت دفاع و پشتیبانی نیروهای مسلح، تصریح کرد: بدون تردید این دست اقدام های ضد انسانی و کوردلانه محکوم به شکست است و خللی در عزم جدی ملت بزرگ ایران در دستیابی به پیشرفت و توسعه در حوزه‌های دفاعی ایجاد نمی کند.  

مشاور مقام معظم رهبری در امور بین‌الملل تأکید کرد: مسببان پیدا و پنهان ترور شهید فخری‌زاده در انتظار انتقام ملت ایران باشند.  

وزیر دفاع و پشتیبانی نیروهای مسلح گفت: شهید فخری‌زاده معاون وزیر دفاع و رئیس سازمان پژوهش و نوآوری دفاعی و دارای یک وجهه علمی و سابقه طولانی در نوآوری‌های دفاعی بود.

رئیس مجلس گفت: انتقام گرفتن از آمران و عاملان جنایت بزرگ ترور محسن فخری‌زاده، هزینه سنگین و غیرقابل بازگشت این ترورها را برای آنها مشخص خواهد کرد.

علی لاریجانی، مشاور مقام معظم رهبری در پی شهادت محسن فخری زاده در حادثه تروریستی پیام تسلیتی صادر کرد.

رئیس دستگاه قضا طی پیامی با تسلیت ترور شهید محسن فخری زاده، دستگاه‌های اطلاعاتی و امنیتی و مراجع قضایی را موظف کرد تا با به‌کارگیری تمام توان اطلاعاتی در جهت شناسایی و دستگیری عناصر مزدور و جنایتکار، کلیه‌ دست اندرکاران این جنایت، مورد محاکمه قرار گرفته و به سزای اعمالشان برسند.

رئیس ستاد کل نیروهای مسلح گفت: گروه‌های تروریستی و آمران و عاملان ترور محسن فخری‌زاده بدانند که انتقام سختی در انتظار آنها خواهد بود.  

دستیار رئیس مجلس در امور بین‌الملل با بیان اینکه دشمنان دست از توطئه بر نمی‌دارند، گفت: ترور فخری زاده نشانگر تلاش محور آمریکایی - صهیونیستی برای تداوم ضربه به پیشرفت علم و فناوری ایران است.  

بعدازظهر جمعه ۷ آذر ۱۳۹۹ عناصر تروریست مسلح خودرو حامل محسن فخری زاده رییس سازمان پژوهش و نوآوری وزارت دفاع را مورد حمله قرار داده و ایشان را به شهادت رساندند.نام فخری‌زاده از طریق لیست سازمان ملل در اختیار موساد قرار گرفته بود. وی در این لیست تحت عنوان «دانشمند ارشد وزارت دفاع و پشتیبانی نیروهای مسلح و رئیس پیشین مرکز تحقیقاتی فیزیک (PHRC)» معرفی ...

وزیر امور خارجه ایران در پیامی در توییتر نوشت که نشانه‌هایی از نقش اسرائیل در ترور شهید فخری زاده وجود دارد.  

  وزیر امور خارجه ایران در بیانیه ای اقدام تروریستی و کوردلانه ترور شهید محسن فخری زاده دانشمند برجسته کشور را به شدت محکوم کرد.  

مشاور فرمانده معظم کل قوا گفت: همچون صاعقه بر سر قاتلان شهید محسن فخری‌زاده مظلوم فرود خواهیم آمد و از کرده خود پشیمان می‌کنیم.  

وزارت دفاع و پشتیبانی نیروهای مسلح، شهادت محسن فخری‌زاده معاون وزیر و رئیس سازمان پژوهش و نوآوری دفاعی (سپند) در یک عملیات تروریستی را تائید کرد.